1、臭氣與水接觸并溶解到水中，臭氣中的有機質由氣相轉移到液相中；溶于水中的臭氣，通過微生物的細胞壁和細胞膜被微生物吸收，不溶于水的臭氣先附著在微生物體外，有微生物分泌的細胞沒分解為可溶性物質，再滲入細胞。在液相中的臭氣成分被微生物吸附、吸收，惡臭成分從水中轉移至微生物內。
2、進入微生物細胞的惡臭成分，作為營養物質被微生物所氧化分解和同化合成，產生的代謝產物一部分溶于液相，一部分作為細胞物質或細胞代謝能源，還有一部分析出空氣中，臭氣通過垃圾除臭劑處理過程不斷減少，從而使污染物得以去除，得到凈化。
